Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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