Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDK3Q15120 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms