Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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UBE4AQ14139 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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UBE4AQ14139 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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UBE4AQ14139 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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