Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms