Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CAMK2BQ13554 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CAMK2BQ13554 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms