Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SF3B2Q13435 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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