Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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