Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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