Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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