Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
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