Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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