Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms