Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms