Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms