Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDGFDQ9GZP0 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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