Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms