Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CDKN3Q16667 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms