Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HIF1AQ16665 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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