Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms