Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL19A1Q14993 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL19A1Q14993 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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