Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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COL9A3Q14050 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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COL9A3Q14050 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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