Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CKAP5Q14008 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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