Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBA3CQ13748 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBA3CQ13748 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBA3CQ13748 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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