Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TCIRG1Q13488 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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