Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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