Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIN2BQ13224 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms