Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RPA4Q13156 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RPA4Q13156 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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