Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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