Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms