Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRGP23470 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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