Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms