Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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RTN1Q16799 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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RTN1Q16799 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RTN1Q16799 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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RTN1Q16799 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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