Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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