Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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