Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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VPS72Q15906 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPS72Q15906 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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