Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms