Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms