Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
UBE4AQ14139 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms