Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCINQ13939 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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CCINQ13939 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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