Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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