Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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