Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms