Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMARCB1Q12824 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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