Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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