Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms