Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNIP3Q9Y2W7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNIP3Q9Y2W7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP3Q9Y2W7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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