Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA3Q9UL41 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms