Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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