Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX15Q9NRS6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms