Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms